中科农民专业合作社财务软件是由北京中科清莲信息技术有限公司研发的农民专业合作社专用财务软件，主要包括账套管理、凭证管理、账簿管理、报表管理等模块，结合了中国农村实际，紧密切合农民合作社应用需求，是农民合作社会计的得力助手，软件适用于农民专业合作社、农民社区股份合作社、土地股份合作社。本系统依据《中华人民共和国农民专业合作社法》和《农民专业合作社财务会计制度》设计，通过软件只需要录入日常发生的业务凭证，各类账页、报表便可自动生成，这对当前合作社财务专业人员短缺，又要规范化管理的提供了解决之道。

一、功能模块
1、 财务管理：
1）支持多账套管理
2）可以根据需要对不同级别的操作人员分配不同的权限
3）自动生成相应的账页、报表，并可以根据需要自定义报表
4）支持反结账功能
5）网络版支持手机查询凭证、账页和报表
2、  会员管理：
对入社社员的基本信息以及发生的业务往来情况进行管理。
3、  购销管理：
包括：商品信息、购销管理（内购、内销、外购、外销）、商品库存管理，可以有效记录合作社的购销情况。
4、 社务管理：涵盖合作社的社务制度、社务日志等功能。
二、版本划分：系统分单机版和网络版。
1、单机版只在本台电脑上使用，适用于合作社单独使用规范内部管理。
2、网络版采用B/S架构，可以通过互联网进行远程登录并进行数据的录入、查询，适用于规模较大、外地设有分社机构的合作总社或是农经主管部门建立监管平台，对管辖的农民专业合作社实行统一管理,并支持手机查询凭证、账页和报表。