中国药典软件以中华人名共和国药典2005版第二部为依据，收载化学药品、抗生素、生化药品、放射性药品及药用辅料共1967种，内容与药典有效符合。
全部药品可通过浏览目录，搜索等方式进行查看，全文内容可通过输入中文名，英文名，化学式，谱图号等词条进行搜索。在查看过程中，可直接点击参照内容中提到的附录，同时对于其中以红外光谱表征的药品，同时可点击查看其红外光谱图（对应药品红外光谱图优质、二、三卷）。