毁灭战士2的故事紧接着前作展开，玩家被再次带到了一个无名的火星空间内，在这里需要闯出一条从这个地狱逃离的路，下载解压缩，安装游戏，运行游戏即可。

毁灭战士2游戏说明：
你是一个优质流的的海军陆战队战士，训练有素，作战勇猛。三年前你因反抗上司向平民开枪的命令而受审。你的上司绑着石膏去了珍珠港，而你则被送到了火星——联合空间公司(UAC)的总部所在。UAC是星际大公司，在火星及火卫一、火卫二上建有放射废弃物处理厂。你的日常工作枯燥而乏味。过去四年中UAC较大的供应商——军方，一直利用火卫一、火卫二的设施进行各种秘密试验，包括异次元的空间旅行。至今他们已经可以在火卫一和火卫二间建立空间门，将东西从一处传往另一处。但近来空间门变得异常不稳定。进入空间门的军方“自愿者”要么就此无影无踪，要么就变得精神错乱，先是粗言秽语，行为暴力，较后就全身爆裂而死。试验人员不得不整天忙着将尸体拼凑起来送回地球。较新的军方报告却声称研究只是遇到一些小挫折，一切尽在掌握中。

几个小时前，火星接到火卫一传来时断时续的信息。“我们请求立刻支援，一些鬼东西正从空间门中出来，电脑系统也有效失控！”其余部分都有效是语无伦次了。很快，火卫二整个就从天上消失了。以后，再也无法和任何一个卫星联系上了。你和你的作战小队，五千万英里内优质一支战斗部队，被火速派往火卫一。你的任务是守卫基地周界，而其余的队员进入基地。以后的几个小时中，你的通讯仪里不断传来各种声音：枪响、作战指令、惨叫、骨折，较后，一片寂静。你的战友们似乎已全部阵亡。事情看来不妙，你无法独自一人离开这个星球。此外，所有的重武器都被队友带走，唯独剩下一支手枪。如果你能找到一把等离子枪，哪怕是一把散弹枪，也能乾掉几个敌人啊。屠杀你战友的，无论是什么东西，都该在它脑门上留下几个弹孔。你戴上钢盔，离开了着陆区。希望空间站里什么地方能找到把好点的武器。走进基地大门，你听见远方走廊里传来一阵动物般的嚎叫声。它们已经发现了你，没有回头路了。